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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Café; Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
Data corrente: |
21/01/2022 |
Data da última atualização: |
05/12/2022 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
TORRES, L. G.; OLIVEIRA, E. J. de; OGBONNA, A. C.; BAUCHET, G. J.; MUELLER, L. A.; AZEVEDO, C. F.; SILVA, F. F.; SIMIQUELI, G. F.; RESENDE, M. D. V. de. |
Afiliação: |
LÍVIA GOMES TORRES, UFV; EDER JORGE DE OLIVEIRA, CNPMF; ALEX C. OGBONNA, CORNELL UNIVERSITY; GUILLAUME J. BAUCHET, BOYCE THOMPSON INSTITUTE; LUKAS A. MUELLER, CORNELL UNIVERSITY; CAMILA FERREIRA AZEVEDO, UFV; FABYANO FONSECA E SILVA, UFV; GUILHERME FERREIRA SIMIQUELI, UFV; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPCa. |
Título: |
Can cross-country genomic predictions be a reasonable strategy to support germplasm exchange? A case study with hydrogen cyanide in cassava. |
Ano de publicação: |
2021 |
Fonte/Imprenta: |
Frontiers in Plant Science, v. 12, 742638, 2021. |
ISSN: |
1664-462X |
DOI: |
https://doi.org/10.3389/fpls.2021.742638 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Genomic prediction (GP) offers great opportunities for accelerated genetic gains by optimizing the breeding pipeline. One of the key factors to be considered is how the training populations (TP) are composed in terms of genetic improvement, kinship/origin, and their impacts on GP. Hydrogen cyanide content (HCN) is a determinant trait to guide cassava?s products usage and processing. This work aimed to achieve the following objectives: (i) evaluate the feasibility of using cross-country (CC) GP between germplasm?s of Embrapa Mandioca e Fruticultura (Embrapa, Brazil) and The International Institute of Tropical Agriculture (IITA, Nigeria) for HCN; (ii) provide an assessment of population structure for the joint dataset; (iii) estimate the genetic parameters based on single nucleotide polymorphisms (SNPs) and a haplotype-approach. Datasets of HCN from Embrapa and IITA breeding programs were analyzed, separately and jointly, with 1,230, 590, and 1,820 clones, respectively. After quality control, ~14K SNPs were used for GP. The genomic estimated breeding values (GEBVs) were predicted based on SNP effects from analyses with TP composed of the following: (i) Embrapa genotypic and phenotypic data, (ii) IITA genotypic and phenotypic data, and (iii) the joint datasets. Comparisons on GEBVs' estimation were made considering the hypothetical situation of not having the phenotypic characterization for a set of clones for a certain research institute/country and might need to use the markers? effects that were trained with data from other research institutes/country's germplasm to estimate their clones? GEBV. Fixation index (FST) among the genetic groups identified within the joint dataset ranged from 0.002 to 0.091. The joint dataset provided an improved accuracy (0.8-0.85) compared to the prediction accuracy of either germplasm?s sources individually (0.51-0.67). CC GP proved to have potential use under the present study's scenario, the correlation between GEBVs predicted with TP from Embrapa and IITA was 0.55 for Embrapa's germplasm, whereas for IITA?s it was 0.1. This seems to be among the first attempts to evaluate the CC GP in plants. As such, a lot of useful new information was provided on the subject, which can guide new research on this very important and emerging field. MenosGenomic prediction (GP) offers great opportunities for accelerated genetic gains by optimizing the breeding pipeline. One of the key factors to be considered is how the training populations (TP) are composed in terms of genetic improvement, kinship/origin, and their impacts on GP. Hydrogen cyanide content (HCN) is a determinant trait to guide cassava?s products usage and processing. This work aimed to achieve the following objectives: (i) evaluate the feasibility of using cross-country (CC) GP between germplasm?s of Embrapa Mandioca e Fruticultura (Embrapa, Brazil) and The International Institute of Tropical Agriculture (IITA, Nigeria) for HCN; (ii) provide an assessment of population structure for the joint dataset; (iii) estimate the genetic parameters based on single nucleotide polymorphisms (SNPs) and a haplotype-approach. Datasets of HCN from Embrapa and IITA breeding programs were analyzed, separately and jointly, with 1,230, 590, and 1,820 clones, respectively. After quality control, ~14K SNPs were used for GP. The genomic estimated breeding values (GEBVs) were predicted based on SNP effects from analyses with TP composed of the following: (i) Embrapa genotypic and phenotypic data, (ii) IITA genotypic and phenotypic data, and (iii) the joint datasets. Comparisons on GEBVs' estimation were made considering the hypothetical situation of not having the phenotypic characterization for a set of clones for a certain research institute/country and might need to use the marke... Mostrar Tudo |
Thesagro: |
Cianeto; Genoma; Germoplasma; Mandioca. |
Thesaurus Nal: |
Breeding; Cassava; Genomics; Hydrogen cyanide; Population structure. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1149230/1/Santos-et-al-ASA-2023.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/230436/1/can-cross-country.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
Data corrente: |
24/02/2015 |
Data da última atualização: |
24/02/2015 |
Tipo da produção científica: |
Documentos |
Autoria: |
MIRANDA, R. A. de; LÍCIO, A. M. A.; PURCINO, A. A. C.; PAULINELLI, A.; PARENTONI, S. N.; DUARTE, J. de O.; GONTIJO NETO, M. M.; LANDAU, E. C.; QUEIROZ, V. A. V.; OLIVEIRA, I. R. de. |
Afiliação: |
RUBENS AUGUSTO DE MIRANDA, CNPMS; ANTONIO MARTINHO ARANTES LICIO, Consultor da Abramilho; ANTONIO ALVARO CORSETTI PURCINO, CNPMS; ALYSSON PAULINELLI, Abramilho; SIDNEY NETTO PARENTONI, CNPMS; JASON DE OLIVEIRA DUARTE, CNPMS; MIGUEL MARQUES GONTIJO NETO, CNPMS; ELENA CHARLOTTE LANDAU, CNPMS; VALERIA APARECIDA VIEIRA QUEIROZ, CNPMS; IVENIO RUBENS DE OLIVEIRA, CNPMS. |
Título: |
Diagnóstico dos problemas e potencialidades da cadeia produtiva do milho no Brasil. |
Ano de publicação: |
2014 |
Fonte/Imprenta: |
Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2014. |
Páginas: |
102 p. |
Série: |
(Embrapa Milho e Sorgo. Documentos, 168). |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Atualmente, o milho é a maior cultura agrícola do mundo e o futuro reserva um papel ainda mais importante para o cereal. O crescimento da renda de países emergentes tem levando ao aumento de consumo mundial de proteína animal, mercado no qual o milho se destaca como principal insumo das rações. Assim, mesmo sem considerar as potencialidades do etanol de milho, o fato é que o mundo demandará ainda mais o cereal nas próximas décadas. Segundo as estimativas realizadas no estudo, o mundo deve demandar 385 milhões de toneladas adicionais de milho em 2020, quando comparados a 2010. O presente documento teve por objetivo de investigar essa demanda potencial de milho no mundo e discutir as possibilidades do Brasil suprir parte desse montante adicional. Nesse sentido entende-se que há quatro pontos chaves fundamentais para o aumento da produção de milho no Brasil, que são: a) áreas novas potenciais; b) áreas potenciais para plantio de segunda safra; c) incorporação de pastagens degradas e Integração Lavoura Pecuária Floresta (iLPF); d) acréscimo de produtividade em áreas que estão abaixo da média nacional e regional. A partir de indicativos recebidos em reuniões realizadas com diversos stakeholders em regiões produtoras e consumidoras de milho no Brasil, estabeleceu-se 9 (nove) áreas que devem ser agraciadas com ações publicas: i) Irrigação; ii) Logística de Armazenagem e Estoques; iii) Logística de transporte; iv) Pesquisa, Desenvolvimento &Inovação; v) Assistência Técnica; vi) Seguro Agrícola; vii) Crédito Rural Orientado; viii) Patrulhas mecanizadas; ix) Outras políticas. MenosAtualmente, o milho é a maior cultura agrícola do mundo e o futuro reserva um papel ainda mais importante para o cereal. O crescimento da renda de países emergentes tem levando ao aumento de consumo mundial de proteína animal, mercado no qual o milho se destaca como principal insumo das rações. Assim, mesmo sem considerar as potencialidades do etanol de milho, o fato é que o mundo demandará ainda mais o cereal nas próximas décadas. Segundo as estimativas realizadas no estudo, o mundo deve demandar 385 milhões de toneladas adicionais de milho em 2020, quando comparados a 2010. O presente documento teve por objetivo de investigar essa demanda potencial de milho no mundo e discutir as possibilidades do Brasil suprir parte desse montante adicional. Nesse sentido entende-se que há quatro pontos chaves fundamentais para o aumento da produção de milho no Brasil, que são: a) áreas novas potenciais; b) áreas potenciais para plantio de segunda safra; c) incorporação de pastagens degradas e Integração Lavoura Pecuária Floresta (iLPF); d) acréscimo de produtividade em áreas que estão abaixo da média nacional e regional. A partir de indicativos recebidos em reuniões realizadas com diversos stakeholders em regiões produtoras e consumidoras de milho no Brasil, estabeleceu-se 9 (nove) áreas que devem ser agraciadas com ações publicas: i) Irrigação; ii) Logística de Armazenagem e Estoques; iii) Logística de transporte; iv) Pesquisa, Desenvolvimento &Inovação; v) Assistência Técnica; vi) Segu... Mostrar Tudo |
Thesagro: |
Demanda; Milho; Produção; Zea mays. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/118533/1/doc-168.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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Registros recuperados : 82 | |
1. | | 0901264, ANAIS DA ESCOLA DE MINAS DE OURO PRETO, Escola de Minas e Metalurgia de Ouro Preto, Ouro Preto, MG Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Semiárido; Embrapa Solos. | |
2. | | 0900505, LAVOURA PARAENSE, Secretaria de Obras Publicas, Terra e Viacao, Belem-PA Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Amazônia Oriental. | |
4. | | 2600132, INDIAN FOREST RECORDS, Forest Research Institute and Colleges, New Delhi, IN Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Florestas. | |
7. | | 0900344, BOLETIM AGRICOLA DE PERNAMBUCO, Uniao dos Sindicatos Agricolas de Pernambuco, Recife-PE Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Semiárido. | |
10. | | 1850049, HOJAS DIVULGADORAS, Ministerio de Agricultura Pesca y Alimentacion, Madrid-Espanha Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Agropecuária Oeste. | |
11. | | 2850004, AGRICOLTURA COLONIALE, Istituto Agricola Coloniale Italiano. Instituto Agronomico per l'Oltremares, Firenze, Italia, IT Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Amazônia Oriental. | |
14. | | 0350176, JAHRBUCH DER CHEMIE, Herausgegeben, Frankfurt-Alemanha Ocidental Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Amazônia Oriental. | |
Registros recuperados : 82 | |
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